Historique de la conservation : A la suite de la mort de Catherine Plan en 1616, Théodore Tronchin a acquis par sa femme, Theodora Rocca (1591-1674), qu'il avait épousée en 1607, ce qui restait des archives de Théodore de Bèze, mort en 1605. Theodora Rocca était la petite-fille issue du premier mariage de Catherine Plan, épouse en secondes noces de Théodore de Bèze.
Les archives de Théodore de Bèze entrées dans le fonds Tronchin contiennent des papiers de la famille de Bèze des XVe et XVIe siècles, des lettres reçues par Théodore de Bèze, mais aussi des lettres provenant de fonds d'archives d'autres réformateurs, que Bèze avait collectées : en vue du choix avec Nicolas Colladon des "Calvini Epistolae", Bèze avait demandé à ses correspondants de lui transmettre les lettres de Calvin qu'ils avaient en leur possession.
Il ne s'agit ici qu'une petite partie de la correspondance reçues par Théodore de Bèze, puisque ce dernier avait vendu en 1598 à l'un de ses pensionnaires, le jeune baron tchèque Wenceslas Morkowsky de Zastrisell, sa bibliothèque et 800 lettres (dont un quart de lettres de Calvin ou à Calvin, le reste à Bèze). Ces 800 lettres partirent alors pour la Bohême (elles seront acquises au XVIIIe siècle par la Bibliothèque ducale de Gotha, où elles sont aujourd'hui toujours conservées).
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